O câncer do colo do útero é o tipo mais comum de câncer causado pelo HPV. Além dele, outros cânceres relacionados ao vírus, embora menos comuns, incluem câncer anal, vulvar, vaginal e peniano, assim como cânceres de boca e garganta. Em 2019, o HPV foi responsável por uma estimativa de 620 mil casos de câncer em mulheres e 70 mil casos de câncer em homens. Entre mulheres, mais de 90% dos cânceres relacionados ao HPV correspondem aos cânceres do colo do útero.  Esses dados evidenciam a relevância do HPV para a saúde pública e mostram que a prevenção do vírus impacta não apenas um tipo de câncer, mas um conjunto de doenças associadas a um mesmo agente. câncer do ânus  embora menos frequente, apresenta forte associação com o HPV. Estima-se que mais de 90% dos casos estejam relacionados ao vírus, com destaque para o HPV 16 como subtipo mais comum, presente em cerca de 70% dos tumores anais. Esse vínculo reforça que estratégias de prevenção do HPV também podem reduzir a ocorrência desse tipo de tumor. câncer da orofaringe  envolve regiões como garganta, amígdalas e base da língua. O tabagismo e o consumo de álcool continuam sendo fatores de risco importantes, mas a infecção pelo HPV tem sido cada vez mais reconhecida como uma das principais causas desse tipo de câncer, especialmente entre pessoas mais jovens. Esse cenário amplia o entendimento do HPV para além do sistema reprodutor e reforça o papel da prevenção em diferentes áreas do corpo. câncer de pênis  também pode estar associado ao HPV. A doença pode atingir homens em diferentes idades e sua prevenção envolve vacinação, uso de preservativo e boa higiene íntima. A associação com o HPV reforça que a prevenção do vírus é relevante também para a saúde masculina. câncer de vulva  afeta a parte externa do sistema reprodutor feminino, como grandes e pequenos lábios e clitóris. É mais comum após a menopausa, mas uma parte dos casos está relacionada à infecção persistente pelo HPV. O câncer de vagina, mais raro, também pode estar associado ao HPV, especialmente quando a infecção permanece por muitos anos sem ser detectada. Ele se desenvolve na parede vaginal e é diferente do câncer do colo do útero e do câncer de vulva.

A infecção por HPV, na maior parte das vezes, é silenciosa e não apresenta sintomas. O sistema imunológico costuma eliminar o vírus naturalmente em um ou dois anos, sem efeitos duradouros. Quando há manifestações, algumas infecções podem causar verrugas genitais, descritas como pequenas elevações ásperas, que podem aparecer na vagina, no pênis ou no ânus e, raramente, na garganta. Essas lesões podem ser dolorosas, causar coceira, sangrar e, em alguns casos, estar associadas a aumento de gânglios. A infecção persistente por HPV de alto risco pode causar alterações nas células do colo do útero, levando a lesões precursoras que podem se tornar câncer se não forem tratadas. Em geral, o câncer do colo do útero leva entre 15 e 20 anos para se desenvolver após a infecção persistente.  As alterações iniciais e os pré-cânceres raramente causam sintomas. Quando surgem sinais do câncer do colo do útero, podem ocorrer sangramento entre períodos ou após relação sexual e corrimento vaginal com odor desagradável. Esses sintomas podem estar relacionados a outras doenças e sempre devem ser avaliados por um profissional de saúde.

A identificação do HPV e a avaliação do risco associado à infecção podem ser realizadas por exames que detectam a presença do vírus e seus subtipos. A pesquisa do genoma do HPV na secreção vaginal permite identificar se há HPV e qual tipo está presente. Os tipos 16 e 18 são os mais associados ao câncer. Desde 2025, o teste molecular de HPV-DNA integra a rede pública de saúde. Esse exame permite identificar a presença e o tipo de HPV, inclusive se é de alto risco para o desenvolvimento do câncer do colo do útero. Quando subtipos de alto risco são detectados, torna-se possível intensificar o acompanhamento e intervir precocemente, evitando a evolução da doença. O rastreamento do câncer do colo do útero busca identificar alterações pré-cancerosas antes que se tornem câncer, quando o tratamento pode prevenir o desenvolvimento da doença.

A vacinação profilática contra o HPV pode prevenir cânceres relacionados ao vírus. Ela é uma das estratégias mais eficazes para prevenir o câncer do colo do útero e também contribui para reduzir outros cânceres associados ao HPV, como os de vagina, vulva, pênis e boca/garganta. A vacina contra o HPV é oferecida gratuitamente pelo SUS para meninas e meninos de 9 a 14 anos, fase em que a proteção é maior. Em situações específicas, a vacinação também está disponível no SUS para mulheres e homens vivendo com HIV, transplantados de órgãos sólidos ou de medula óssea e pacientes oncológicos entre 9 e 45 anos, além de vítimas de violência sexual dos 9 aos 45 anos e usuários de PrEP. Há ainda menção a casos especiais como papilomatose laríngea recorrente. Na rede privada, a vacinação também pode ser realizada em outras idades, conforme orientação médica. Há vacinas com coberturas diferentes. No SUS, é utilizada a vacina quadrivalente, que protege contra HPV 6, 11, 16 e 18. Na rede privada, a vacina nonavalente oferece cobertura ampliada para mais tipos do vírus.  A vacinação previne a infecção pelos tipos mais perigosos, justamente aqueles responsáveis pela maioria dos cânceres associados ao HPV.